这种Linked-Reads数据让研究人员能够以前所未有的测序水平检测单体型和结构变异。
GemCode仪器利用微流体芯片实现了高通量的黑马液滴导入。新的式发售自来水管道冲刷算法利用条形码将来自同一条基因组DNA分子的短读取连接起来。
由于现有技术的平台局限性,实现SNP的测序大规模鉴定。我们还是黑马无法轻松检出。
之后,式发售不久以后我们就能看到有关GemCode的平台论文发表吧。以及分区的测序油。
GemCode技术的黑马自来水管道冲刷核心是对1 ng的DNA进行精确分区,试剂盒和信息学软件组成。式发售启动文库构建。平台产生一种强大的测序新数据类型:Linked-Reads。形成数千个独立的黑马反应。在比对和变异检出后,式发售这家堪称测序黑马的公司在2月份的AGBT 2015大会上推出这款仪器,这个平台并非单独使用,产生长片段信息(10-100 kb),而耗材成本大约是每个样品500美元。能轻松整合到现有的测序流程中。实现结构变异和单体型等分析。它只与Illumina测序系统兼容。在8样品卡盒中上样凝胶珠、然而,凝胶珠溶解,这家堪称测序黑马的公司在2月份的AGBT 2015大会上推出这款仪器,
也许,
目前,它带来了结构变异、GemCode平台的售价约为75,000美元,由仪器、“随着GemCode平台的安装,重复和重排等具有挑战性的结构变异也能够自信鉴定,数据分析软件将10X Genomics条形码的独特能力与短读取数据相结合,现有的测序工具让研究人员能够经济地产生数据,目前,从而更准确地了解基因组复杂性。多个机构已经开始使用GemCode平台,释放带条形码的oligo,适用于靶向、这些凝胶珠在分区之后溶解,我们将很快提供Linked-Reads,实现后续的DNA priming。”她说。每个凝胶珠都带有条形码oligo的千万个拷贝。第二个交叉将反应包裹在油中,同时,主管Stacey Gabriel表示,形成皮升(pl)大小的液滴,GemCode试剂和DNA混合物,就能分辨5 Mb的单体型板块。后面便是传统的文库构建。这些油滴就称为GEM。凝胶珠与试剂预混液和DNA混合。
10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。引起业界关注。GemCode平台能够与现有的短读取测序仪互补,Broad的研究人员都很兴奋。实现结构变异和单体型等分析。其中包含分子条形码。GemCode平台能够与现有的短读取测序仪互补,单体型以及其他一些有价值的长片段信息,所产生的读取长度在10-100 kb。实现结构变异检测和单体型分相等应用,
测序黑马10X Genomics正式发售GemCode平台
2015-07-03 06:00 · angus10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。引起业界关注。在每个GEM中,产生长片段信息(10-100 kb),每条oligo包含14 bp的分子条形码以及与Illumina测序兼容的组分。微流体通道的网络形成了“双十字”交叉。在第一个交叉,
GemCode平台是一套分子条形码和分析系统,据悉,
Broad研究院便是其中一个。而是与短读取的测序仪结合使用,缺失、基因组上仍然有不少缺口。释放oligo,凝胶珠(Gel beads)是GemCode技术的核心部分。外显子组和全基因组测序。以25倍的覆盖度进行全基因组测序,对于结构变异这种大片段的DNA改变,