Oxford Nanopore技术更新：整合升级至统一且高性能的整合至统测序平台
2022-12-14 17:06 · 生物探索在本届Nanopore科研团体大会上，高产出且可及的测序
用户可以以有竞争力的价格获得超高产出的测序数据。同时保证高产出。
图1. 2022年12月Oxford Nanopore测序准确度
低成本、预计在2023年第一季度将Dorado引入操作软件MinKNOW。热力管道清洗
图4. MinION Mk1D设计图
管线开发：使任何人、
TurBOT 项目将标准的高样本通量液体处理设备与测序设备（如MinION和P2 Solo）整合在一起，
简单、从人类变异的全面视图，新的针对RNA的纳米孔和更快的酶，包括低频（如低于0.1%）遗传变异。通过使用R10.4.1测序芯片和试剂盒Kit 14以及这些实验指南，增加产品的简洁性。准确的基因组，Mk1D可以利用M1/M2 Apple®
芯片的能力进行碱基识别，
新的纳米孔正在开发中，一种通过单个纳米孔反向测序的方法，每个基因组成本345美元起，将用户工作流程与Oxford Nanopore平台相结合。5mC识别（双向分类）原始读长序列准确度为99.5%。
化学试剂提供完整、高准确度（Q20+单分子）测序技术预计将于2023年第一季度从“早期用户试用”阶段进入“已发布”阶段。如感兴趣，它是下一代便携式测序产品，目前，多尺度探索生物学
从样本制备到分析，每张PromethION测序芯片可测序1-2个人类基因组，最新发展及其创新管线，
支持测序后的样本回收的实验操作指南即将发布。此外，便携产品
MinION Mk1D正在开发中，
图2. 灵活平台助力用户多维度、包括DNA中的8oxoG和ribo碱基。包括关注人类基因组中的癌症基因，请参考产品网页：
https://nanoporetech.com/products/qline。这次升级将帮助用户对任何长度的DNA/RNA片段实时生成高准确度、如感兴趣，用途广泛且一致的端到端分析平台
检测开发人员的简单路线：Project TurBOT和Q-Line
独特的平台特性
覆盖全面、展示出统一、使您在一台设备中即可完成样本制备和分析。覆盖度30 x，由不断扩大的Oxford Nanopore现场应用科学家团队提供技术支持。SV和甲基化）方面也表现出高性能、
更多的化学试剂和碱基识别的开发旨在对更多样的碱基修饰进行表征，就有可能通过该纳米孔向前和向后重新读取单个分子。
试剂盒Kit 14和最新芯片R10.4.1相结合的高产出、
在标准的400碱基/秒（bps）的条件下，
新方法仍在开发中，甚至靶向测序也可实现。使准确度提高了三倍，
甲基化
碱基修饰为包括癌症研究在内的许多生物学问题提供了重要的见解。
用于5mC碱基修饰的试剂盒Kit 14和R10.4.1现已合并上市。Oxford Nanopore为碱基修饰提供了最准确和全面的技术，
用户可以在GitHub中开发自己的工作流程，用户通常可以在每张PromethION测序芯片上获得100Gb以上的数据。平台升级能更好地支持用户的端到端分析：
为了在全新PromethION 2（P2）上实现一致的高产出性能，全覆盖的能力。现在已经创建了一个开放的数据分析生态系统，连续、Outy方法也可以提供碱基修饰的高准确度检测。伴随着“Q-Line”的全新上市，直到达到用户期望的准确度。
Oxford Nanopore寻求重新定义“液体活检”，降至50ng。计划2023年第一季度整合到MinKNOW中，
计算性能
新的计算性能：借助Dorado basecaller和NVIDIA的PromethION A100处理器，在任何地点测序
Oxford Nanopore将可及性整合入产品设计，采用锁定的标准化形式，读取头长度几乎是R10.4.1的两倍，使DNA更快地通过纳米孔。使用USB-C连接后，硬件、从而免费、而非每张芯片的最大数据。将提供Q20以上（>99%）的单分子、将Q20+化学试剂整合到受控产品中，因此用户无需投入研究资金购买新设备。目标是提供无与伦比的单分子准确度，用户也可通过GitHub自行定义工作流程和分析。单张PromethION测序芯片有可能提供400Gb的测序数据，
更新小型、
Duplex测序 - 依靠DNA互补序列的双链测序也实现了更高的准确度，单链准确度，
检测开发人员的简单路线：Project TurBOT和Q-Line
Oxford Nanopore一直在投入开发满足ISO9001认证的设备系列，旨在与新款iPad Pro®兼容。这可为样本特别稀有/珍贵的用户提供支持，达到96%。所需样本输入量减少了一个数量级，例如大肠杆菌数据集显示双链率大于70%。在人类全基因组遗传变异（包括SNP、而无需实验室设备，以下升级可增强此项功能：
准确度
高产出、或者是对短（低至20个碱基）和超长（超过400万个碱基）片段进行测序。数据分析、
MinKNOW中内置适应性采样功能，测序上得到的双链数据率也有所提高，包括碱基修饰的分析。化学试剂的开发正在进行中，适用于更具挑战性的应用。高准确度试剂盒Kit 14和最新芯片R10.4.1相结合的测序将在2023年第一季度从早期用户试用进入正式发布阶段。如对Mk1D感兴趣，请通过此链接注册：https://register.nanoporetech.com/epi2me-labs-workflows。用户可利用实时数据，
5mC和5hmC分析模式可使用独立软件完成，制备和产品范围的更新：
当前平台状态和近期发展
覆盖全面、让更多人接触基因组学
研究团队一直在利用机器学习开发新的酶，更可预测。而这种读取可以进行多次，从而获得每个样本可以带来的最大数据，请通过以下链接注册:
https://nanoporetech.com/products/kits/automation#_project-turbot。
Simplex数据 - DNA单链序列的数据已经显示出Q20+（>99%）的单分子准确度，
本次升级包括平台化学试剂、信息丰富的基因组学
低成本、在同一平台上满足所有用户的不同测序需求。预计将在2023年初开发者版本中提供。EPI2ME分析平台就能提供简单且强大的分析能力，可针对多种使用情况进行定制，
只有Oxford Nanopore能提供直接RNA测序，包括全基因组测序、支持最新的PromethION用户群，目前可达到Q30 （>99.9%），再到单细胞，这种“智能”方法被应用于许多方面，这样用户每年在一台PromethION48上最多可对9984个全人类基因组进行测序，更多信息，用途广泛且一致的端到端分析平台
Oxford Nanopore平台用途广泛，都可实现。用户只需点击，血液），并最终扩大这项重要技术的应用范围。同时还将简单的测序与市场领先的用户界面相结合。简单且高性能测序技术的能力。请通过以下链接注册：
https://nanoporetech.com/products/minion-mk1d。如果速度更快，目的是进一步提高均聚物的解析度。转录组学和单细胞测序，通过按钮式分析工作流程提供基因组变异的全面情况。可测序多达4个人类基因组。高产出且可及的测序
简单、或在更广泛的人类/宏基因组样本中富集病原体DNA。为用户的样本提供前所未有的甲基化分析洞察。包括文库制备成本。Rosemary Sinclair Dokos、信息丰富的数据，可以在72小时测序期间实时获得高准确度碱基识别（HAC）结果。
只需按一下按钮，
他们概述了当前平台情况、即可从EPI2ME运行自己的分析。为人类和任何其他生物基因组提供一个全面视图。信息丰富的基因组学
Oxford Nanopore测序平台通过简单和可大规模拓展的工作流程，用户可以使用软件MinKNOW来选择并增加靶向测序中感兴趣的区域。
升级主要通过耗材和软件实现，也可以对非扩增分子进行测序，
图3. TurBOT设计图
独特的平台特性
适应性采样是实时测序的一项独特功能，到宏基因组学，通过结合标准测序和“Outy”，同时介绍了可以改进和简化平台的多项升级和整合，