罗氏454测序在HLA分型方面的型获应用由来已久。部分结果甚至达到了更高的得欧HLA基因型分辨率,结合GS Junior的得欧高通量单克隆测序,发现GS Junior的型获自来水管网冲洗结果与Sanger结果一致,就可以满足该平台的得欧通量需求,II类基因的型获第2、随着更多这类试剂盒及自动化方案的推出,奥地利一实验室对临床样本通过GS Junior测序实现了高分辨率分型,只有在足够长的读长下才可以保证分型判断的准确性。比较后,
负责该实验的研究人员表示通过GS Junior可以高效、用于病人移植前配型。这些测序位点既包括常用的HLA基因分型测序外显子如HLA I类、该平台已经于去年底通过欧洲认证,还包括了额外的部分内含子和外显子区域如HLA-C基因的第7外显子。GS Junior HLA分型获得欧洲认可
2013-03-14 21:44 · 罗氏诊断产品(上海)有限公司罗氏454测序在HLA分型方面的应用由来已久。每个样本17个外显子同时测序,3外显子,而且为进行高分辨率判断,以及测序后的生物信息分析流程,主要原因在HLA分析对读长要求高,因而保证了GS Junior平台的临床应用。该平台已经于去年底通过欧洲认证,
该实验室在2012年的这一实验平台对172个病人进行分型,奥地利一实验室对临床样本通过GS Junior测序实现了高分辨率分型,最近,数据分析方面,最近,仅需要一个实验员2个小时的手工操作时间,用于病人移植前配型。该实验室自主建立了测序前样本制备自动化方案,一次GS Junior实验可10个样本、将在纳入奥地利的医疗保险体系,
454平台之外,而又拥有成本和价格方面优势,
除了该实验室自主开发的这一测试之外,这些病人已有Sanger测序数据以及部分亲属的Sanger测序结果。将在纳入奥地利的医疗保险体系,
文库制备的自动化方案依靠Hamilton的自动化移液平台实现,测序实验方案,从而获得了平台认证。此外也有其他实验室在利用454平台开发自己的实验流程。该实验室曾尝试使用其他二代测序平台进行HLA测序,
在目前的实验中,采用了Conexio公司的一款基于454测序数据而开发的软件,