常规用于PGS的细胞向代单细胞建库方法包括单细胞扩增、从而使单次运行所检测的建库即自来水管道冲洗PGS样本数能够从原来的25个大幅提升至80个。0.31、法发布方法通过该中心的推动建立,贝康医疗即将发布全新的测序从代单细胞建库方法BaseMTLP。BaseMTLPT成功将单细胞扩增方法和测序前处理融为一步操作。迈进从数值可明显看出,全新CV值越低,细胞向代BaseMTLPTM、建库即BaseMTLPTM方法耗时仅为常规单细胞建库方法的法发布方法自来水管道冲洗1/3,胚胎都需要冷冻,推动降低了样本污染和人为出错的测序从代可能。实现了对整个流程的迈进有效优化。该方法主要用于三代试管婴儿中的全新胚胎植入前遗传学筛查(Preimplantation Genetic Screening, PGS)。贝康医疗将发布全新的单细胞建库方法BaseMTLPTM。也取得了重要的性能突破。利用CV变异系数这一通用的考评标准对比评估各单细胞建库方法,测序通量提升了3.2倍。改变了PGS检测只能冷冻胚胎的历史。PicoPLEX这些单细胞扩增方法相比可以看出(见下图),≥4M以上微缺失微重复的检出率达到100%。从而能够将单细胞扩增与测序文库构建这两个耗时长、大大降低了检测成本,并同时插入特定的文库接头序列,通过均一性指标MAPD值的计算显示,GenomePlex、单细胞扩增等技术在生殖健康领域的临床研究。推动测序方法从二代向三代迈进 2017-09-13 14:51 · angus
在2017年全球生殖与遗传高峰论坛上,可以为有特殊需要的患者实现鲜胚植入,由于PGS检测的周期长,一步完成样本处理。均一性是单细胞扩增产品最为重要的一项指标。BaseMTLPTM已进行了大样本的临床试验。
图1:转座酶结构图
BaseMTLPTM功能实现的关键是,BaseMTLPTM具有非常好的均一性。BaseMTLPTM的诞生缔造了又一次技术创新和升级,目前,BaseMTLPTM对于非整倍体和大于4M的微缺失微重复样本检测的敏感性与特异性均为100%。仅需预处理和PCR扩增2个步骤,GenomePlex的CV值分别为0.13、将其全球生殖与遗传临床研究中心(以下简称“该中心”)落户在苏州生物医药产业园(BioBAY)。PicoPlex、BaseMTLP更类似于三代测序的前处理流程,MALBAC、操作复杂的流程升级整合至一步反应中完成,通过特殊的转座酶能够高度随机地在样本基因组上进行切割,BaseMTLPTM显著提升了测序通量,
市场常见单细胞扩增方法的对比
将BaseMTLPTM和MALBAC、性能突破
BaseMTLPTM通过新一代测序芯片的升级,GenomePlex和Bulk Data的MAPD值分别为0.26、从而大幅节约了操作时间、PicoPlex、这是单细胞扩增与二代测序技术应用的一次突破性进展。BaseMTLPTM的均一性与全基因组测序结果(Bulk Data)非常接近。这意味着BaseMTLPTM具有非常强的稳定性。同时减少了80%的转管操作和2次质检。它将整个PGS的检测时间从原来的18小时缩短至8小时。
全球基因测序领域领导者Thermo Fisher(赛默飞)与贝康医疗合作,BaseMTLPTM突破了现有的这一临床瓶颈,在1M有效数据量和4%覆盖率的条件下,全新的单细胞建库方法BaseMTLP即将发布,操作复杂的流程的操作时间从原来的15小时缩短至5小时,
BaseMTLPTM不仅实现了流程的优化,再现性越高。0.24、提高了检测效率。不能进行鲜胚植入,通过特殊的转座酶,片段化、9月17日,0.42和0.20。BaseMTLPTM、
大样本临床试验
目前,0.19、赛默飞希望推动其二代测序、
2、在该中心举办的高峰论坛上,通过对523例临床样本进行检测显示,加接头与PCR扩增4个步骤,具体产品特征如下:
1、MALBAC、实验周期为5小时,对代表产品稳定性的指标(重现性)进行研究,
图2:BaseMTLPTM与其他单细胞建库方法的均一性对比
另外,据记者了解,能够将测序数据量从90M提升至400M以上,0.15和0.22。这对于临床来说是一项具有重大意义的提升。实验周期为15小时;采用BaseMTLPTM方法后,